نحن ندرك تماماً بأن الكنيسة ليست مبنىً عاديًا، بل هي أفراد ومؤسسات مُنظمة وفقًا لقواعد تنظيمية. لذلك لدينا في مجتمعنا الكنسي العديد من المجالس المستقلة، وكل مجلس مُكلف بصلاحيات كاملة لتطوير المؤسسات وفقًا لأهدافه. فيما يلي المجالس الرئيسية مع رؤاها ومشاريعها المُوكلة إليه:

• المجلس الأعلى للتبشير والتلمذة
• المجلس الأعلى للاستثمار والتنمية الاقتصادية
• المجلس الأعلى للتخطيط وإدارة المشاريع
• المجلس الأعلى للمصالحة وبناء السلام
• المجلس الأعلى للاتصال والعلاقات العامة
• المجلس الأعلى للتعليم وبناء القدرات
• المجلس الأعلى للصحة والأمن البشري
• المجلس الأعلى لإدارة الكوارث والتنمية المستدامة
• المجلس الأعلى للمساواة بين الجنسين وتمكين المرأة
• المجلس الأعلى لتنمية الشباب والأجيال